L'église de Beaujeu mélange deux styles bien distincts : roman et gothique. Cette église était dans un tel état de vétusté qu'en 1823 l'archevêque de Besançon menaçait d’en interdire l’accès. La reconstruction a été entreprise en 1870. Principal attrait, le vitrail le plus ancien de la région Franche-Comté, daté de 1481.
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dalle funéraire de Jean de Beaujeu, seigneur de Chazeuil, et de ses trois femmes, Catherine de Cherme, Marguerite de Meyte et Marguerite de Cherme
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dalle funéraire de Jehan Perrin, de Montot, curé de Pierrejux
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dalle funéraire de Jean II de Beaujeu, et de sa femme, Mathieuote (de Queutrey)
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cloche
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calice, patène